Selon le Département de l’enquête et de la cartographie de la Malaisie, le pays est constitué d’îles 878. 394 de ces îles font partie de l'état de Sabah. Le pays possède également des entités géographiques offshore 510 qui ne sont pas classées comme des îles, telles que des arêtes, des bancs de sable ou des roches. La plupart des îles de Sabah sont nommées, mais un nombre important d'îles restent anonymes.
Îles Supérieures à 250,000
Bornéo
Bien que l'île de Bornéo ne soit pas entièrement occupée par la Malaisie, c'est le plus grand territoire d'une île faisant partie de la Malaisie. Environ 26% de la superficie de l'île est occupée par les états malaisiens de Sabah et Sarawak. Seulement 1% de la superficie de l'île appartient à la nation de Brunei, tandis que le reste de l'île de Bornéo fait partie de l'Indonésie. Sabah est située dans la partie nord de l'île et est bordée respectivement par le Kalimantan d'Indonésie et le Sarawak de Malaisie au sud et au sud-ouest. Sarawak est situé sur la partie nord-ouest de l'île et est bordé respectivement par Sabah et Kalimantan au nord-est et au sud. L'Etat indépendant du Brunei borde le Sarawak au nord.
L'île de Sebatik
Comme Bornéo, l'île de Sebatik est également partagée par différentes entités politiques. L'île est divisée en territoires indonésiens et malaisiens. L'île est située à environ 1 km au large de la côte est de Bornéo et occupe une superficie de km2 452.2. La partie nord de l'île de Sebatik fait partie de l'État malais de Sabah et compte une population d'environ 25,000. La partie sud de l'île fait partie du Kalimantan du nord de l'Indonésie et compte une population d'environ 80,000.
Îles Supérieures à 200
Ile Banggi
Située près de la baie de Marudu et au large de la côte nord de Sabah, l'île de Banggi est une île de Malaisie qui fait partie de la division Kudat de l'État de Sabah. C'est la plus grande île exclusivement occupée par la Malaisie et occupe une superficie de 440.7 km2. L'île a une population de personnes 30,000.
Île Bruit
Située dans le delta du Rejang, l'île malaisienne de Bruit fait partie de l'état du Sarawak. L'île a une population d'environ 30,000 et est la deuxième plus grande île exclusivement occupée par la Malaisie. Deux points de ferry relient l'île à la Malaisie continentale et à d'autres îles. Plusieurs villages de pêcheurs parsèment la côte de Bruit, le plus grand étant Kampung Semop.
Langkawi
Langkawi est un archipel malaisien situé dans la mer d'Andaman, à environ 30 km de la côte de la Malaisie continentale. Les îles de Langkawi font partie de l'État malaisien de Kedah. La plus grande île de l'archipel est l'île de Langkawi, qui compte une population de 64,792. Parmi les îles 99 de l'archipel, seules quatre sont habitées. Outre Langkawi, les autres îles habitées comprennent Dayang Bunting, Rebak et Tuba. La population totale de l'archipel est constituée de personnes appartenant à la communauté 99,000 et constitue une destination touristique prisée en raison de la pléthore d'attractions naturelles et artificielles.
L'île de Penang
Avec une superficie de km carré 293, l'île de Penang est la quatrième plus grande île exclusivement occupée par la Malaisie. L'île abrite George Town, la ville la plus peuplée des îles et la deuxième ville la plus peuplée de Malaisie. L'île a une population d'environ 738,500 et une densité de population d'environ 2,372 personnes par km carré. Le détroit de Penang sépare l’île de la péninsule malaise.
En plus des îles mentionnées ci-dessus, la Malaisie compte plusieurs îles de taille inférieure à 200. Aman (Penang), Sipadan (Sabah), Malacca (Malacca) et Rawa (Johor) sont des exemples de ces îles.
